183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0411 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0411  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3001  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4192  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0453  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  32.73 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 335 aa  53.9  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 306 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 117 aa  51.6  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0132  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  33.98 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 132 aa  51.6  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4201  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0130  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0138  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  41.27 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2924  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3713  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000895581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  38.96 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  34.58 
 
 		 130 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2820  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0091  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3843  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 128 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 119 aa  47.8  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  38.1 
 
 		 136 aa  47.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4735  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0840  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.413569 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  38.1 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1556  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.659749  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49570  transcriptional regulatory protein, MerR family  34.29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0397848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3780  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  30.93 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  30.93 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3058  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2743  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2472  regulatory protein, MerR  41.94 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2034  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327556  normal  0.554633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0576  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0456359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1034  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  45.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 128 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 128 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  39.34 
 
 		 124 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  37.5 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2012  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474573  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4036  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>