239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3001 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3001  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  330  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0411  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 131 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4735  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 132 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 342 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 342 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 342 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 268 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  33.93 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 343 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  29.81 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 342 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  33 
 
 		 278 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2924  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 131 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 252 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2844  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  37.63 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 320 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 334 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.94 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2820  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 213 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 342 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  36.63 
 
 		 342 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 342 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  34.31 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 343 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.56 
 
 		 259 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 327 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3843  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0085  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0091  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  34.65 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0138  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0130  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  36.54 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 127 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 129 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0082  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 117 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0086  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 117 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 343 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 343 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 128 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 257 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>