More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0951 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  29.71 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  29.71 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 		 213 aa  70.5  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  34.15 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  31.48 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  31.48 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  27.41 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  30.63 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  29.52 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  28.15 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  26.28 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  30.34 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  36.23 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  25.71 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  25.55 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  26.27 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  25.55 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  23.36 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  23.81 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  26.47 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  29.76 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  26.47 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  29.76 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 302 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  27.48 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  26.09 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  22.46 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  25.53 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  24.68 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  24.8 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  30.61 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>