More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5725 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  35.33 
 
 		 160 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  35.33 
 
 		 160 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  26.62 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 161 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  31.06 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  28.15 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  25.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  25.37 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  31.19 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  31.19 
 
 		 144 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  31.19 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  38.24 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 92 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 130 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 391 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  29.36 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 130 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 134 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  38.24 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  37.33 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 157 aa  52.4  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.76 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  36.76 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  36.76 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  36.76 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 119 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 253 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.76 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 137 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  33.06 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  27.16 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 130 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 342 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  36.76 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  36.76 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 125 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  27.43 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  27.43 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  29.2 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  27.43 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  27.43 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 		 135 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  32.08 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  29.2 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 165 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  26.5 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>