More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2870 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2870  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  34.95 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  32.76 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  37.38 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  29.36 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  35.4 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  29.06 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.78 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  32.2 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  23.58 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  31.13 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  26.85 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  26.85 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  28.04 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  23.68 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.17 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4002  MerR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  25.66 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  27.36 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  34.58 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.84 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  34.91 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  38.18 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  35 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.07 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>