214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3271 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3271  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 127 aa  263  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.71 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  31.15 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4277  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4363  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0411786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4656  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.871775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.2 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.51 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  32.48 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.6 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  29.85 
 
 		 271 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4811  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  27.59 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0267  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2769  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.545239  normal  0.552398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  31.45 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  33.63 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  31.36 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.45 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  48.21 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2513  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 230 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1373  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.65 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  26.45 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  31.36 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  49.02 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1922  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>