More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6164 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6164  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 137 aa  270  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  34.85 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3271  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  29.2 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.9 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.51 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  29.01 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9086  putative transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  29.84 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3439  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  33.61 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2950  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  30.25 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  30.63 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 659 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 630 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 630 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.95 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 254 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.23 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.36 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  28.47 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  28.44 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 343 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.46 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 354 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00260  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.96 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  26.23 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  39.74 
 
 		 253 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  30.63 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4656  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.871775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1373  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4363  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0411786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>