More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3082 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  36.21 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.86 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.86 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  33.67 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.42 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  36.08 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 342 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  32.71 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 336 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2891  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 265 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 339 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 122 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  30.91 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 253 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 342 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 354 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  27.36 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  31.82 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  27.36 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 343 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3871  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  27.36 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  31.82 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>