121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4190 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
218 aa  174  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  40.76 
 
 
225 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  33 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
307 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  26.81 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.81 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.81 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.09 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.76 
 
 
215 aa  51.6  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  28.35 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  26.76 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  31.9 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.73 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
232 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  31.97 
 
 
253 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
274 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
214 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  30.17 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  29.25 
 
 
288 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  25.45 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  34.58 
 
 
192 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  31.93 
 
 
196 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  31.82 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  30.58 
 
 
320 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.93 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  26.85 
 
 
254 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  29.29 
 
 
236 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2280  methyltransferase type 12  28.04 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  29.29 
 
 
236 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
225 aa  44.7  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  40.38 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
1759 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
637 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  36.89 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  23.73 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.28 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  28.28 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  25.9 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  25.73 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  28.28 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.3 
 
 
251 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  26.19 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.41 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  25 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.61 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  23.65 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  29 
 
 
292 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  25.24 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0298  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
263 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.82 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.97 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
274 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.83 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31.65 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.45 
 
 
263 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.77 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  29.91 
 
 
261 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
264 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
208 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
279 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.48 
 
 
221 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.05 
 
 
253 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
241 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
301 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.32 
 
 
3639 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
236 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 
263 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>