More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2132 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  100 
 
 
207 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  100 
 
 
207 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  100 
 
 
207 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  70.2 
 
 
203 aa  254  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  72.47 
 
 
178 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  60.91 
 
 
204 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.75 
 
 
256 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.75 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.75 
 
 
256 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.75 
 
 
256 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.75 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
256 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
257 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.41 
 
 
256 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.05 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.05 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.05 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.89 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
254 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
274 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  38.19 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.06 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.62 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  46.08 
 
 
271 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.86 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  43.27 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.26 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  44.66 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.58 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  43.8 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.08 
 
 
251 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  40 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.08 
 
 
251 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
242 aa  72  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 
1106 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  51.52 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.22 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  44 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  30.63 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  36 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.48 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  40.43 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.23 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  43.52 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.1 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.81 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  45.1 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  45.1 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  45.1 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  45.1 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.13 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46770  predicted protein  35.57 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  35.62 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  35.04 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  44 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  31.71 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
282 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.95 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  41.59 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  46.46 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  39.42 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.86 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  46.94 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  44.12 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>