More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2558 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  78.83 
 
 		 478 aa  806    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  66.03 
 
 		 482 aa  651    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 480 aa  999    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  66.6 
 
 		 476 aa  661    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  66.17 
 
 		 488 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  61.81 
 
 		 476 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  62.34 
 
 		 477 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  43.8 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  45.04 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  39.45 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  39.04 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  37.84 
 
 		 476 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  37.42 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  36.79 
 
 		 479 aa  315  9e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  41.36 
 
 		 472 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  36.65 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  38.35 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  36.15 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  36.94 
 
 		 465 aa  299  9e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  36.24 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  34.95 
 
 		 453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  37.98 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  33.91 
 
 		 460 aa  275  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  32.69 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  32.48 
 
 		 454 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  32.69 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  35.77 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  32.48 
 
 		 458 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  32.69 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  32.48 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  32.48 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  32.2 
 
 		 460 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  35.85 
 
 		 459 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 457 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  35.28 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  31.52 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  35.71 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  35.53 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  34.13 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  33.4 
 
 		 457 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  32.31 
 
 		 455 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  34.01 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  33.05 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.44 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.63 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  33.63 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  33.63 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  32.98 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.63 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  35.24 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  32.62 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  33.87 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  33.87 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  33.63 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.41 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.26 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  31.5 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  33.7 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  30.79 
 
 		 455 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 387 aa  239  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.12 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.12 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  31.66 
 
 		 460 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  31.24 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.42 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.72 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  30.39 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.77 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  30.39 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  30.11 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  32.97 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  32.88 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  29.91 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  34.21 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  32.26 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  32.42 
 
 		 572 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  30 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  30.85 
 
 		 448 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  30.48 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  31.52 
 
 		 397 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.24 
 
 		 401 aa  220  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.84 
 
 		 489 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  32.47 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.57 
 
 		 453 aa  217  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  29.88 
 
 		 457 aa  216  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  29.64 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  31.64 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.57 
 
 		 464 aa  214  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  32.12 
 
 		 405 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  32.41 
 
 		 554 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  29.98 
 
 		 451 aa  209  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  31.42 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.56 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  31.26 
 
 		 536 aa  206  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>