More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1585 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  100 
 
 		 471 aa  971    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  45.74 
 
 		 488 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  44.64 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  45.59 
 
 		 478 aa  388  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  40.9 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  45.04 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  44.99 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  44.04 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  43.66 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  44.09 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  43.22 
 
 		 482 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  41.99 
 
 		 476 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  39.18 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  40.39 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  38.66 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  41.13 
 
 		 465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  41.05 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  40.18 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  37.23 
 
 		 458 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  40.09 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  37.01 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  37.01 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  37.01 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  37.01 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  36.42 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  37.01 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  37.01 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  37.01 
 
 		 458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  38.13 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  36.8 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  36.8 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  37.2 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 470 aa  329  6e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  37.99 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  39.26 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  38.97 
 
 		 468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  35.82 
 
 		 460 aa  318  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  37.94 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  36.64 
 
 		 453 aa  315  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.9 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.76 
 
 		 452 aa  312  9e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  39.13 
 
 		 479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  36.54 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  34.68 
 
 		 468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  35.5 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.31 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  37.31 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  40.69 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  33.62 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  34.61 
 
 		 459 aa  289  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  39.06 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.12 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  34.12 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  34.12 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.12 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.12 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  34.12 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  34.12 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  34.33 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 453 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 453 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  34.34 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  34.79 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.9 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  35.21 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  32.62 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  33.55 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  33.55 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  38.24 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  32.97 
 
 		 455 aa  270  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  33.26 
 
 		 463 aa  269  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35.53 
 
 		 458 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  35.58 
 
 		 485 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  34.61 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.26 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.48 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.49 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 470 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.35 
 
 		 485 aa  249  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  32.82 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  35.11 
 
 		 462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  31.09 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  28.85 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  32.07 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  31.94 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  30.56 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 495 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.9 
 
 		 456 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  33.5 
 
 		 554 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  31.79 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.49 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.4 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  29.16 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.75 
 
 		 439 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>