More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3305 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 460 aa  944    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  66.15 
 
 		 460 aa  618  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  65.43 
 
 		 461 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  65.43 
 
 		 461 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  65.11 
 
 		 455 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  60.13 
 
 		 457 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  55.3 
 
 		 485 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  52.64 
 
 		 455 aa  487  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  38.97 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.9 
 
 		 458 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  38.9 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  38.68 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  38.24 
 
 		 458 aa  358  8e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  38.24 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  38.24 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  38.46 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  38.46 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  38.46 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  38.82 
 
 		 453 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  40.84 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  39.74 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  38.63 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  40.75 
 
 		 453 aa  339  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.82 
 
 		 465 aa  333  3e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  39.11 
 
 		 465 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  37.86 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  37.25 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  35.65 
 
 		 453 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  35.65 
 
 		 453 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  36.98 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  38.11 
 
 		 457 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  35.27 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.27 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.27 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  34.96 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  34.96 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.27 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  35.04 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  35.04 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  35.04 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  34.81 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  38.61 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  33.7 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.62 
 
 		 471 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  35.31 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  32.24 
 
 		 453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  34.01 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.85 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.17 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  34.93 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.77 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  36.62 
 
 		 458 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.19 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  32.31 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  32.96 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  34.2 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  34.42 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  34.76 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  35.45 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.13 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  34.77 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.58 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  32.49 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.59 
 
 		 458 aa  249  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  32.82 
 
 		 489 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.2 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.31 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.7 
 
 		 488 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.26 
 
 		 495 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  34.35 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  32.46 
 
 		 572 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  32.52 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  32.1 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  30.95 
 
 		 479 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  30.7 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  30.13 
 
 		 481 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.55 
 
 		 462 aa  240  5e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  30.71 
 
 		 479 aa  239  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  32.27 
 
 		 482 aa  239  8e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  30.36 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  31.72 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  31.66 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  30.59 
 
 		 465 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  31.01 
 
 		 476 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  33.78 
 
 		 423 aa  236  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  32.31 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  31.93 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  30.2 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.04 
 
 		 493 aa  232  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  34.01 
 
 		 439 aa  232  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.17 
 
 		 513 aa  232  9e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  30.79 
 
 		 476 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>