More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2261 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  100 
 
 		 457 aa  941    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  50.33 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  45.52 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  44.84 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  46.59 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  46.31 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  42.11 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  43.4 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  43.05 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  44.77 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  44.82 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  44.74 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  42.83 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  42.73 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  42.83 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  42.6 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  42.83 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  42.51 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  42.83 
 
 		 454 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  42.6 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  42.6 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  42.89 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  41.22 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  41.7 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  40 
 
 		 459 aa  359  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  39.56 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  39.56 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  39.64 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  39.64 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.64 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.64 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.64 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  39.56 
 
 		 459 aa  358  9e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  38.99 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  38.99 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  40.76 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  39.2 
 
 		 459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  40.99 
 
 		 473 aa  355  7.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  39.69 
 
 		 467 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 458 aa  352  8e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  37.97 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  38.17 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  37.94 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  41.1 
 
 		 459 aa  339  8e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  38.89 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  40.35 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  39.19 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  37.94 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  37.61 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  42.78 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  37.31 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  39.23 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  36.77 
 
 		 461 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  36.77 
 
 		 461 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  37.86 
 
 		 456 aa  305  8.000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.33 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  38.11 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  37.69 
 
 		 451 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  39.3 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  38.44 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.91 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  38.11 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  37.19 
 
 		 493 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  36.15 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.4 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  35.34 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  36.47 
 
 		 572 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  35.34 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  38.39 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  35.96 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  36.75 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  38.84 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.53 
 
 		 464 aa  279  6e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.83 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  34.69 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  35.74 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  36.99 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  34.7 
 
 		 476 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  35.71 
 
 		 455 aa  276  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  36.7 
 
 		 465 aa  276  8e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  33.91 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  33.04 
 
 		 451 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  34.59 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  34.37 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.83 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  32.97 
 
 		 479 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.97 
 
 		 478 aa  267  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  33.76 
 
 		 480 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  34.65 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  35.27 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  32.31 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  35.09 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  34.88 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  33.41 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.54 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  34.12 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>