More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03000 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 
453 aa  925    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  44.7 
 
 
460 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  44.39 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  44.39 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  43.95 
 
 
458 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  44.17 
 
 
454 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  44.17 
 
 
454 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  44.17 
 
 
458 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  43.72 
 
 
458 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  43.95 
 
 
458 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  44.17 
 
 
458 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  43.95 
 
 
458 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  45.21 
 
 
457 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  44.72 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  42.13 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  44.8 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  47.18 
 
 
454 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  42.11 
 
 
457 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  41.16 
 
 
460 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  41.07 
 
 
467 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  40.35 
 
 
468 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  40.51 
 
 
453 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  40.51 
 
 
453 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  41.18 
 
 
456 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  41.24 
 
 
448 aa  359  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  38.12 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.12 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  38.12 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  38.12 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.12 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  38.26 
 
 
459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  38.12 
 
 
459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  38.12 
 
 
459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.12 
 
 
459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  37.58 
 
 
459 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  37.81 
 
 
458 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  42.69 
 
 
451 aa  349  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  40.49 
 
 
465 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  39.37 
 
 
453 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  40.18 
 
 
460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  40.75 
 
 
460 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  40.09 
 
 
455 aa  338  8e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  39.73 
 
 
457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  39.64 
 
 
455 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  39.06 
 
 
489 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  39.6 
 
 
455 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  38.13 
 
 
471 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.86 
 
 
455 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  39.39 
 
 
461 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  39.39 
 
 
461 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  39.14 
 
 
459 aa  322  7e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.16 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  39.23 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  37.78 
 
 
451 aa  317  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  37.98 
 
 
466 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  37.75 
 
 
436 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  37.92 
 
 
454 aa  312  9e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  38.31 
 
 
572 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  36.97 
 
 
493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  37.98 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  36.9 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  38.03 
 
 
447 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  37.86 
 
 
470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  39.15 
 
 
495 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  35.6 
 
 
468 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  36.63 
 
 
451 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  35.41 
 
 
488 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  35.21 
 
 
479 aa  293  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  36.38 
 
 
439 aa  291  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.91 
 
 
456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  34.38 
 
 
451 aa  288  9e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  34.68 
 
 
468 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  37 
 
 
464 aa  288  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  39.15 
 
 
452 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  34.33 
 
 
479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  35.76 
 
 
470 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  36.89 
 
 
488 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  35.48 
 
 
457 aa  280  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  35.53 
 
 
477 aa  277  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  35.96 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  34.47 
 
 
476 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  34.82 
 
 
456 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  36.01 
 
 
446 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  37.56 
 
 
554 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  33.84 
 
 
481 aa  270  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  34.37 
 
 
470 aa  269  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  34.88 
 
 
471 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  34.38 
 
 
468 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.71 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.84 
 
 
513 aa  266  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  34.6 
 
 
478 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 
462 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  34.19 
 
 
476 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.32 
 
 
462 aa  263  6.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  31.5 
 
 
465 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.15 
 
 
465 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  36.42 
 
 
472 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.41 
 
 
458 aa  261  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  34 
 
 
485 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>