More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2060 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  100 
 
 		 468 aa  959    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  55.86 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  44.1 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  39.75 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  39.19 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  38.97 
 
 		 471 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  35.6 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  33.91 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  34.8 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  33.84 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 479 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  36.02 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  33.85 
 
 		 452 aa  276  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  34.27 
 
 		 460 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  32.89 
 
 		 460 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  34.9 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  32.69 
 
 		 471 aa  269  8.999999999999999e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.93 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.71 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 458 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  32.44 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  33.12 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  32.44 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  31.56 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  32.44 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  32.44 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  34.34 
 
 		 465 aa  263  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  30.6 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  32 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.39 
 
 		 459 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.95 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.95 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.95 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  31.21 
 
 		 458 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  31.43 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 459 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  32.41 
 
 		 488 aa  259  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 459 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  32.14 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  32.14 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  30.95 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  33.97 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  31.8 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  33.19 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.45 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  34.33 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  32 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  32.15 
 
 		 463 aa  251  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  32.84 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2251  (Uracil-5)-methyltransferase  35.63 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000149323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  34.43 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  33.11 
 
 		 457 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  30.75 
 
 		 465 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  30.8 
 
 		 476 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  31.94 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 495 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  34.95 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.1 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.1 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.43 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  28.85 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  30.17 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.92 
 
 		 452 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.5 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.17 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  31.35 
 
 		 455 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  28.26 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  35.36 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  29.23 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.13 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  31.37 
 
 		 572 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.23 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  34.46 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.78 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  28.85 
 
 		 456 aa  228  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  28.98 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.07 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.53 
 
 		 489 aa  222  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  30.5 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  29.58 
 
 		 439 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  34.28 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  29.3 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  31.19 
 
 		 554 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  28.1 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  28.32 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  32.15 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  26.11 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  27.09 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  33.48 
 
 		 446 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.6 
 
 		 485 aa  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.07 
 
 		 458 aa  209  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>