More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1989 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 451 aa  905    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  49.89 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  37.25 
 
 		 448 aa  303  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  36.63 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  33.41 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  35.45 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  33.93 
 
 		 459 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  34 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  31.11 
 
 		 457 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 457 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  30.73 
 
 		 458 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  30.96 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  30.73 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.6 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  30.73 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  30.51 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  30.73 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.93 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 468 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  31.71 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  31.56 
 
 		 459 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  33.56 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  34.65 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  32.09 
 
 		 457 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  33.55 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.11 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  32.96 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  31.79 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  31.79 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  31.54 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  31.54 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.54 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.54 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.96 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  31.54 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  32.09 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  30.92 
 
 		 456 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.32 
 
 		 459 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  31.35 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  31.32 
 
 		 459 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  31.93 
 
 		 453 aa  253  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  31.93 
 
 		 453 aa  253  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  30.29 
 
 		 467 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  31.32 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  35.51 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.19 
 
 		 456 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 458 aa  246  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  28.85 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  29.98 
 
 		 455 aa  244  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  30.4 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  32.1 
 
 		 460 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.51 
 
 		 513 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  29.2 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.87 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.26 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  29.78 
 
 		 495 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  28.44 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.07 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  30.45 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  30.45 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.87 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.41 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.2 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.47 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  29.62 
 
 		 473 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  32.05 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  26.47 
 
 		 479 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  29.23 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  34.4 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  30.16 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  30.75 
 
 		 572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  29.12 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.95 
 
 		 493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  30.98 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  29.89 
 
 		 466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  30.48 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.44 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  30.7 
 
 		 446 aa  209  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  30.06 
 
 		 476 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  29.78 
 
 		 479 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  28.76 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  32.53 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  26.96 
 
 		 493 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  31.77 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  29 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  26.96 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  32.52 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  30.79 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  26.43 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  30.82 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.53 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>