More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1332 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 447 aa  917    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  94.84 
 
 		 572 aa  879    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  65.24 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  57.24 
 
 		 493 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  57.11 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  50 
 
 		 485 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  49.21 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  44.92 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  38.6 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  39.95 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  38.71 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  37.92 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  38.71 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  38.48 
 
 		 454 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  38.48 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  38.39 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  38.19 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  38.25 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  38.25 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  38.25 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  36.04 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  38.03 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.26 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  38.39 
 
 		 454 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  36.09 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  38.01 
 
 		 448 aa  292  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  36.09 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  36.09 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  35.65 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  35.88 
 
 		 459 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  35.88 
 
 		 459 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.88 
 
 		 459 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.88 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.88 
 
 		 459 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  35.65 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  35.44 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  35.44 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  38.78 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  34.4 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  35.96 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  34.64 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  36.01 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  35.01 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35.81 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  34.09 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  33.03 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  36.28 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.3 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  33.41 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.6 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  32.88 
 
 		 468 aa  249  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.05 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  32.52 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  36.71 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.41 
 
 		 456 aa  242  7.999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.26 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  33.56 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  32.26 
 
 		 479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  32.36 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.14 
 
 		 496 aa  240  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.4 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.13 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.13 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  32.61 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.13 
 
 		 464 aa  233  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  31.5 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  32.7 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  32.11 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  32.26 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  30.2 
 
 		 455 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  29.23 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  31.75 
 
 		 554 aa  222  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 471 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  30.13 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  30.75 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.68 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.21 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.19 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  33.63 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  30.69 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  31.87 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  32.43 
 
 		 468 aa  216  9e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  29.74 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  31.95 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  33.64 
 
 		 476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  31.12 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  31.81 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  30.22 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  34.47 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  29.52 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.32 
 
 		 462 aa  206  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.82 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.69 
 
 		 513 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  29.02 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  29.56 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>