More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2309 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  100 
 
 		 493 aa  1001    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  54.26 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  54.74 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  52.84 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  53.96 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  49.77 
 
 		 572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  49.21 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  48.06 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 453 aa  302  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  36.67 
 
 		 457 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  35.86 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  34.61 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 458 aa  293  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  34.61 
 
 		 458 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  34.61 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  34.61 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  34.23 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  34.61 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  34.38 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  33.55 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  33.55 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  35.48 
 
 		 460 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  34.51 
 
 		 459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  34.51 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  33.7 
 
 		 459 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.29 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.37 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  34.37 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  34.37 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  34.37 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  34.37 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.37 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  35.96 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  33.92 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  33.71 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.05 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  33.18 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  35.16 
 
 		 454 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 455 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  33.87 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  33.41 
 
 		 458 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.81 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  34.3 
 
 		 457 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  33.41 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  33.41 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.57 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.89 
 
 		 450 aa  249  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  36.53 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.08 
 
 		 458 aa  246  8e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  31.35 
 
 		 468 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  32.05 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  34.42 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  32.21 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.94 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.94 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  31.57 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  30.32 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.84 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  34.4 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.75 
 
 		 456 aa  227  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  38.83 
 
 		 438 aa  227  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.04 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  35.01 
 
 		 473 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  33.51 
 
 		 554 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  30.02 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  31.53 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.33 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.74 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  31.83 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  34.88 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.53 
 
 		 401 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  31.04 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  30.18 
 
 		 439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  32.95 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  29.95 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.06 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  29.95 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  31.44 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  26.2 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  30.95 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  30.87 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.72 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  26.96 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  33.49 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  27.59 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  29.45 
 
 		 479 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.62 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  31.6 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.44 
 
 		 496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  32.73 
 
 		 476 aa  199  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  29.62 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  30.27 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  26.67 
 
 		 446 aa  197  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.14 
 
 		 465 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  28.82 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  30.14 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  29.2 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>