More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0413 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  100 
 
 		 451 aa  934    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  73.56 
 
 		 439 aa  689    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  57.98 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  51.23 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  51.01 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  50.78 
 
 		 459 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  50.78 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  50.78 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  50.78 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  50.78 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  50.78 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  50.56 
 
 		 459 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  50.56 
 
 		 459 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  50.34 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  50.34 
 
 		 467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  50 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  48.68 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  47.78 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  43.08 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  40.73 
 
 		 460 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  40.78 
 
 		 458 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  40.55 
 
 		 458 aa  348  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  40.78 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  40.78 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  40.55 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  40.55 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  40.55 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  40.32 
 
 		 454 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  40.09 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  40.09 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  40.42 
 
 		 459 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  39.63 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  37.19 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.74 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  38.74 
 
 		 455 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  37.61 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  36.98 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  36.98 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  38.03 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  36.87 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  37.69 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  35.31 
 
 		 465 aa  296  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.37 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  34.38 
 
 		 453 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  33.78 
 
 		 454 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  34.39 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  35.09 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  35.82 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35.2 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.36 
 
 		 464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  32.8 
 
 		 451 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.41 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  33.41 
 
 		 451 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.27 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.99 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  30.44 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  30.53 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.11 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.89 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  34.7 
 
 		 554 aa  239  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.49 
 
 		 458 aa  239  9e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  32.13 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  30.2 
 
 		 460 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  29.65 
 
 		 466 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.29 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  31.03 
 
 		 572 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  31.72 
 
 		 462 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.72 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  29.35 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  29.14 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.24 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.13 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  29.14 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  29.12 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  28.6 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  30.97 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  30.23 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  33.03 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  29.31 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  33.01 
 
 		 415 aa  212  9e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  26.94 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  30.14 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  29.88 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.24 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  31.22 
 
 		 479 aa  209  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  28.31 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  26.2 
 
 		 493 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  32.9 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.83 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  27.03 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  30.62 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  29.68 
 
 		 476 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  28.17 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  29.61 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.66 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  29.82 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  28.54 
 
 		 480 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.86 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>