More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0702 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  73.78 
 
 
451 aa  715    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 
453 aa  933    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  56.89 
 
 
456 aa  525  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  52.65 
 
 
459 aa  495  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  46 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  47.22 
 
 
450 aa  438  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  44.67 
 
 
458 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  43.81 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  43.33 
 
 
458 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  43.33 
 
 
458 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  43.56 
 
 
458 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  43.33 
 
 
458 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  43.11 
 
 
454 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  43.56 
 
 
458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  43.11 
 
 
454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  43.11 
 
 
458 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  43.11 
 
 
458 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  45.56 
 
 
458 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  43.5 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  43.5 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  43.57 
 
 
457 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  42.44 
 
 
456 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  42.38 
 
 
459 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  43.18 
 
 
460 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  39.56 
 
 
453 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  41.14 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  40.76 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  41.72 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  37.89 
 
 
455 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  39.37 
 
 
453 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.44 
 
 
455 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  39.47 
 
 
463 aa  339  7e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
465 aa  329  7e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  36.65 
 
 
448 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  39.14 
 
 
459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  37.7 
 
 
459 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  43.12 
 
 
554 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.78 
 
 
459 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  37.87 
 
 
459 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  37.78 
 
 
459 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  37.78 
 
 
459 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.78 
 
 
459 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  37.87 
 
 
459 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  37.76 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.33 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  37.56 
 
 
458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  35.25 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  37.73 
 
 
460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  37.92 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35.49 
 
 
458 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  34.38 
 
 
457 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  35.25 
 
 
467 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  35.43 
 
 
468 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  37.63 
 
 
438 aa  286  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  35.25 
 
 
439 aa  286  8e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  35.09 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  32.24 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.84 
 
 
513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.38 
 
 
460 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.55 
 
 
496 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  33.92 
 
 
461 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  33.92 
 
 
461 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
473 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.64 
 
 
485 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  34.06 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  33.85 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.79 
 
 
401 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  31.93 
 
 
451 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.99 
 
 
455 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.63 
 
 
572 aa  266  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  34.09 
 
 
447 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  32.06 
 
 
479 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.88 
 
 
493 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  33.7 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 
436 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  33.26 
 
 
470 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  36.23 
 
 
415 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.79 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.7 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  33.41 
 
 
456 aa  252  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  34.4 
 
 
471 aa  250  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  32.34 
 
 
488 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.8 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  34.55 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.25 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  31.87 
 
 
462 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  32.97 
 
 
481 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02120  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.57 
 
 
543 aa  242  9e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  32.67 
 
 
485 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  32.68 
 
 
470 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.67 
 
 
495 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  30.57 
 
 
493 aa  239  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  32.53 
 
 
470 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  31.74 
 
 
536 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  30.99 
 
 
456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.16 
 
 
471 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  32.34 
 
 
479 aa  233  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  30.7 
 
 
465 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  29.74 
 
 
473 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  30.96 
 
 
449 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>