More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1216 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  100 
 
 
452 aa  914    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  50.33 
 
 
463 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  49.78 
 
 
451 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  49.56 
 
 
452 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  46.7 
 
 
456 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  43.54 
 
 
457 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  43.04 
 
 
466 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  42.67 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  35.65 
 
 
488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  37.87 
 
 
466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.97 
 
 
479 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  39.15 
 
 
453 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.77 
 
 
471 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  37.8 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.85 
 
 
468 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  34.95 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  37.55 
 
 
481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  36.14 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  36.25 
 
 
478 aa  283  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  36.44 
 
 
488 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  35.89 
 
 
460 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  34.47 
 
 
476 aa  279  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  34.22 
 
 
453 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  36.13 
 
 
470 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  36.81 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  36.79 
 
 
470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.97 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  33.7 
 
 
453 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  34.88 
 
 
457 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  36.73 
 
 
476 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.44 
 
 
455 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  34.13 
 
 
458 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  35.84 
 
 
465 aa  269  8e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  35.39 
 
 
465 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  35.06 
 
 
482 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  34.51 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  34.51 
 
 
458 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  34.51 
 
 
458 aa  267  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  34.51 
 
 
458 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  34.51 
 
 
458 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  34.51 
 
 
458 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  31.78 
 
 
457 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  34.51 
 
 
454 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  34.51 
 
 
458 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  35.82 
 
 
465 aa  266  7e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  34.29 
 
 
454 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  36.94 
 
 
454 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  31.95 
 
 
468 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  33.48 
 
 
480 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  35.79 
 
 
459 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  35.63 
 
 
479 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  35.59 
 
 
471 aa  257  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  33.48 
 
 
468 aa  253  6e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.54 
 
 
456 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.36 
 
 
489 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  32.08 
 
 
453 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  32.08 
 
 
453 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  36.45 
 
 
472 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  30.55 
 
 
461 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  30.55 
 
 
461 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  31.72 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.92 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.65 
 
 
450 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  34.45 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  34.08 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  34.08 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.08 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.08 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.58 
 
 
459 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  33.93 
 
 
459 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  33.93 
 
 
459 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  32.85 
 
 
473 aa  243  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  34.22 
 
 
459 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  30.96 
 
 
457 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  34.72 
 
 
458 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  31.66 
 
 
470 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  31.22 
 
 
476 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  34.57 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  34.36 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  31.02 
 
 
457 aa  239  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  33.7 
 
 
451 aa  237  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  32.24 
 
 
536 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  33.63 
 
 
458 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.89 
 
 
495 aa  236  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  33.19 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 
572 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  32.73 
 
 
439 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  33.11 
 
 
451 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  32.82 
 
 
467 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  32.59 
 
 
446 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  32.73 
 
 
439 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  35 
 
 
451 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.94 
 
 
485 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.38 
 
 
460 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  32.62 
 
 
438 aa  227  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.39 
 
 
485 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  31.61 
 
 
448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  31 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  32.3 
 
 
446 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.52 
 
 
401 aa  225  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>