More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2518 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  100 
 
 		 479 aa  995    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  57.33 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  56.06 
 
 		 470 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  55.58 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  56.62 
 
 		 465 aa  521  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  54.64 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  54.08 
 
 		 465 aa  511  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  54.45 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  51.45 
 
 		 468 aa  501  1e-141  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  52.45 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  40.9 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  41.7 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  38.64 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  38.35 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  37.13 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  36.79 
 
 		 480 aa  315  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  38.2 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  35.99 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  35.32 
 
 		 476 aa  312  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  35.15 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  35.21 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  35.68 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  35.09 
 
 		 460 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  34.65 
 
 		 457 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  35.46 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  35.02 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  35.24 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  35.02 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 453 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  35.02 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  35.45 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  35.02 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  34.8 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 458 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  35.6 
 
 		 459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  32.92 
 
 		 479 aa  269  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  35.13 
 
 		 459 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  35.13 
 
 		 459 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  34.76 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.76 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  34.07 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  34.98 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.76 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  32.97 
 
 		 457 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  34.91 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.55 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  35.43 
 
 		 436 aa  266  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  34.33 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.63 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  34.77 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  35.37 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  34.48 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  33.7 
 
 		 467 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.57 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  33.62 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.64 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  35.89 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 456 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  32.6 
 
 		 458 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  35.78 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  33.06 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  34.25 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.32 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  30.98 
 
 		 455 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  31.47 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  34.08 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  30.71 
 
 		 460 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  34.14 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.24 
 
 		 485 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  32.34 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  32.09 
 
 		 451 aa  232  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  30.69 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  30.2 
 
 		 454 aa  225  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.61 
 
 		 455 aa  225  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  31.59 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  34.59 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.95 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  29.68 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  32.1 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.21 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  34.6 
 
 		 387 aa  218  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  31.53 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.37 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.83 
 
 		 401 aa  214  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  32.94 
 
 		 554 aa  213  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  32.8 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  31.22 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  29.98 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>