More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0633 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  100 
 
 
451 aa  931    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  73.78 
 
 
453 aa  715    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  54.67 
 
 
456 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  50.55 
 
 
459 aa  471  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  45.43 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  43.62 
 
 
458 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  46.53 
 
 
450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  42.76 
 
 
460 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  43.18 
 
 
458 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  43.18 
 
 
458 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  43.18 
 
 
458 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  43.34 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  42.73 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  42.95 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  42.73 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  42.73 
 
 
458 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  42.73 
 
 
458 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  43.95 
 
 
453 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  43.95 
 
 
453 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  42.6 
 
 
459 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  41.33 
 
 
456 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  42.22 
 
 
458 aa  365  1e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  38 
 
 
453 aa  352  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  38.33 
 
 
455 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.33 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  38.17 
 
 
457 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  37.3 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  39.77 
 
 
454 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  38.82 
 
 
468 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  40.36 
 
 
463 aa  322  6e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  37.78 
 
 
453 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  37.99 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  37.05 
 
 
448 aa  312  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  37.07 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  37.07 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.07 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.07 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  37.13 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  36.7 
 
 
465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  37.01 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.84 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  37.01 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  36.78 
 
 
459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  36.73 
 
 
451 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  36.78 
 
 
458 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  34.9 
 
 
458 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  36.38 
 
 
460 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  34.62 
 
 
454 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  40.05 
 
 
554 aa  289  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  34.6 
 
 
457 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  35.42 
 
 
468 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  34.22 
 
 
467 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.85 
 
 
460 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  33.19 
 
 
455 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.59 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  33.85 
 
 
461 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.91 
 
 
513 aa  266  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  33.85 
 
 
461 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  33.11 
 
 
439 aa  266  7e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  31.58 
 
 
460 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  34.48 
 
 
466 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  34.24 
 
 
473 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  31.71 
 
 
451 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.47 
 
 
401 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  35.88 
 
 
438 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  32.8 
 
 
451 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.47 
 
 
496 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.78 
 
 
436 aa  259  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.63 
 
 
572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.41 
 
 
447 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  33.98 
 
 
481 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.95 
 
 
493 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  34.99 
 
 
415 aa  249  7e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  30.43 
 
 
479 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  33.97 
 
 
471 aa  245  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  31.24 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.15 
 
 
485 aa  243  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  31.47 
 
 
470 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.62 
 
 
477 aa  236  6e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.92 
 
 
488 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.85 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  32.15 
 
 
456 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  31.29 
 
 
470 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02120  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.45 
 
 
543 aa  231  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.33 
 
 
462 aa  230  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  31.37 
 
 
470 aa  230  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  30.97 
 
 
465 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  30.56 
 
 
482 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  30.72 
 
 
476 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  31.38 
 
 
456 aa  227  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf754  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.14 
 
 
449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  33.7 
 
 
452 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.67 
 
 
485 aa  226  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  32.19 
 
 
465 aa  225  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.16 
 
 
471 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  30.69 
 
 
479 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  31.7 
 
 
472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.67 
 
 
495 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  30.33 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>