More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0542 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  64.85 
 
 
467 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  96.51 
 
 
459 aa  922    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  100 
 
 
459 aa  949    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  98.69 
 
 
459 aa  937    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  99.13 
 
 
459 aa  942    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  99.13 
 
 
459 aa  942    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  99.13 
 
 
459 aa  941    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  92.14 
 
 
458 aa  885    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  98.69 
 
 
459 aa  937    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  99.13 
 
 
459 aa  942    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  99.13 
 
 
459 aa  942    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  97.81 
 
 
459 aa  930    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  69.87 
 
 
460 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  51.01 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  48.46 
 
 
468 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  48.34 
 
 
496 aa  450  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  48.4 
 
 
439 aa  437  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  46.34 
 
 
460 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  46.77 
 
 
458 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  46.21 
 
 
458 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  46.21 
 
 
458 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  46.21 
 
 
458 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  46.33 
 
 
458 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  45.88 
 
 
454 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  45.54 
 
 
454 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  45.98 
 
 
458 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  45.98 
 
 
458 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  45.39 
 
 
457 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  45.21 
 
 
458 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  46.43 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  44.51 
 
 
513 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  43.38 
 
 
453 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  43.38 
 
 
453 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  43.58 
 
 
456 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  40.87 
 
 
460 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.95 
 
 
455 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  43.72 
 
 
455 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  40.8 
 
 
454 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  40.4 
 
 
453 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  40.04 
 
 
468 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  41.86 
 
 
462 aa  361  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  40 
 
 
457 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  38.26 
 
 
453 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  39.2 
 
 
448 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  38.88 
 
 
458 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  39.82 
 
 
459 aa  341  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  39.39 
 
 
465 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  37.92 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  36.85 
 
 
473 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  39.29 
 
 
436 aa  323  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  36.55 
 
 
457 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  37.7 
 
 
453 aa  317  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  39.9 
 
 
554 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  37.02 
 
 
451 aa  309  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  37.13 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.89 
 
 
450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  34.19 
 
 
489 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.57 
 
 
455 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  35.73 
 
 
572 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.04 
 
 
458 aa  301  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  35.04 
 
 
460 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  33.77 
 
 
470 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  33.92 
 
 
461 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  33.92 
 
 
461 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.75 
 
 
464 aa  293  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.4 
 
 
401 aa  293  6e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.57 
 
 
456 aa  292  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.15 
 
 
460 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  34.61 
 
 
471 aa  289  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  35.65 
 
 
447 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  34.08 
 
 
455 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.35 
 
 
485 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  35.41 
 
 
495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.22 
 
 
493 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.79 
 
 
485 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  35.27 
 
 
438 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.19 
 
 
466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  34.51 
 
 
493 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  34.33 
 
 
479 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.71 
 
 
488 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  34.25 
 
 
470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.1 
 
 
463 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  33.62 
 
 
462 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  31.43 
 
 
468 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  32.62 
 
 
465 aa  257  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  32.62 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  33.92 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  32.72 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  32.58 
 
 
536 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  31.32 
 
 
451 aa  253  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  32.98 
 
 
481 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  32.26 
 
 
488 aa  253  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  32.4 
 
 
476 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  31.66 
 
 
482 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  32.42 
 
 
468 aa  250  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.03 
 
 
477 aa  247  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  31.57 
 
 
479 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  35.79 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  32.44 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  32.43 
 
 
439 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>