More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1134 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  100 
 
 		 469 aa  955    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  66.96 
 
 		 465 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  53.76 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  43.85 
 
 		 457 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.43 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  41.28 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  41.28 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  40.84 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  40.81 
 
 		 460 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  40.13 
 
 		 455 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.56 
 
 		 485 aa  305  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  34.73 
 
 		 458 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 458 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  34.67 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 458 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  34.44 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  32.37 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  34.22 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  34.22 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  31.71 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  31.55 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  32.51 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  33.04 
 
 		 459 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.8 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  31.19 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  30 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  30 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  31.07 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  28.92 
 
 		 456 aa  239  9e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  29.55 
 
 		 455 aa  232  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.09 
 
 		 455 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 453 aa  223  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  33.62 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  29.58 
 
 		 458 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  30.31 
 
 		 457 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.84 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  33.26 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  27.8 
 
 		 456 aa  216  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  29.83 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  28.92 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  29.17 
 
 		 459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.02 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.67 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  28.48 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  28.48 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.48 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.99 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.48 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 459 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 459 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  29.01 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  30.5 
 
 		 572 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.24 
 
 		 436 aa  210  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.26 
 
 		 459 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  29.05 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  30.5 
 
 		 495 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  27.96 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.82 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  31.88 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.11 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  29.78 
 
 		 459 aa  203  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  28.79 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.31 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  31.21 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  30.09 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  30.6 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  27.01 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  28.66 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  26.49 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.26 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.27 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  29.39 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  27.65 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  27.65 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  26.21 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  30.68 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  31.18 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  26.44 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  29.42 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2519  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.98 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  27.86 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  29.03 
 
 		 493 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  26.72 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  28.95 
 
 		 405 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  27.21 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.89 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  29.26 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.8 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  27.6 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3098  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.78 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000185167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0848  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.46 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000210259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3116  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0559824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  31.11 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  28.89 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>