15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0306 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0306  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.407855 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  40.5 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  32.56 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  29.63 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  29.41 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  26.45 
 
 
206 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  26.87 
 
 
265 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  31.82 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  25.2 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  25.69 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  29.77 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  23.53 
 
 
236 aa  42  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>