More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3055 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3055  methyltransferase type 11  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346509  normal  0.0118845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  88.42 
 
 		 285 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.87 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  40.3 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.73 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.45 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.54 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.05 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.98 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.37 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 624 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.51 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.38 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.51 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.07 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.96 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.62 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.68 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  25 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.35 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2748  methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.3 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.89 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  34.23 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  37.29 
 
 		 1014 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.03 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.93 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  29.3 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.63 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.8 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  27.51 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  33.09 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.01 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00656  Uncharacterized methyltransferase AN0656 (EC 2.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFM4]  29.61 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.529096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2017  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  32.26 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.84 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.01 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.84 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.66 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.66 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  30 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  37.04 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>