38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2227 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1065    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  44.53 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  44.1 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  41.13 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  36.88 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  29.35 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  32.51 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  30.05 
 
 		 590 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  31.07 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  31.07 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  31.07 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  30.79 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  30.79 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  30.79 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  30.79 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  28.16 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  28.11 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  28.64 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  25.93 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  22.79 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  24.73 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  27.34 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  28.81 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  27.78 
 
 		 518 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  24.35 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  24.83 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 252 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  23.2 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  25.62 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  23.9 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 1144 aa  57.4  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  24.88 
 
 		 1116 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 1143 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2463  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.01 
 
 		 242 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>