251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2369 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  43.54 
 
 
535 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  44.5 
 
 
535 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  37.06 
 
 
564 aa  148  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  42.02 
 
 
542 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  35.75 
 
 
535 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  39.43 
 
 
509 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
518 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  38.17 
 
 
523 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  38.71 
 
 
503 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 
494 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  37.57 
 
 
521 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  37.57 
 
 
486 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  37.33 
 
 
482 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  36.96 
 
 
419 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  28.24 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  33.33 
 
 
508 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 
1143 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  33.51 
 
 
1144 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  39.23 
 
 
499 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  33.15 
 
 
1116 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  37.84 
 
 
518 aa  87  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  35.88 
 
 
499 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  35.88 
 
 
499 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  35.88 
 
 
499 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  35.88 
 
 
499 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  35.88 
 
 
499 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  35.29 
 
 
499 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  35.29 
 
 
499 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  30.3 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  34.32 
 
 
590 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  32.03 
 
 
510 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  33.75 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
511 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  42.67 
 
 
366 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  31.13 
 
 
400 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  31.01 
 
 
507 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
360 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.21 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
399 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30 
 
 
344 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  36.71 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
400 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0820  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0149  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0586457  hitchhiker  0.00000543036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0821  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  23.96 
 
 
395 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 
441 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 
441 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
511 aa  52  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.91 
 
 
287 aa  52  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3025  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.08 
 
 
239 aa  52  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.4 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  26.32 
 
 
414 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
440 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  35.59 
 
 
376 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.46 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  25.34 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  24.75 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.71 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 
365 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28.71 
 
 
263 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  31.11 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  28.89 
 
 
241 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
380 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
360 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  24.71 
 
 
390 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 
391 aa  48.5  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
367 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  35.53 
 
 
316 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  30.17 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
439 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  36.36 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.27 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.27 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  25.85 
 
 
399 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.69 
 
 
447 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.07 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3237  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.08 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  31.97 
 
 
341 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
360 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  32.89 
 
 
315 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1560  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.86 
 
 
382 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138047  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0883  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.71 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>