58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0475 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  100 
 
 
499 aa  989    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  42.34 
 
 
510 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  37 
 
 
511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  31.56 
 
 
511 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  37.92 
 
 
518 aa  219  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  36.88 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  32.65 
 
 
590 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  32.2 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  32.5 
 
 
507 aa  136  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  33.46 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  29.86 
 
 
512 aa  128  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  26.16 
 
 
486 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  33.97 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  30.86 
 
 
419 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  28.04 
 
 
508 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  26.62 
 
 
523 aa  106  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  24.92 
 
 
514 aa  98.6  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  29.3 
 
 
509 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  25.67 
 
 
564 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  28.84 
 
 
535 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  30.61 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  36.57 
 
 
535 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  39.23 
 
 
252 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 
482 aa  89  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  25 
 
 
494 aa  87.4  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  24.42 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  24.2 
 
 
1144 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  24.37 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
1143 aa  77.4  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  24.43 
 
 
1116 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3543  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  29.66 
 
 
405 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3609  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  28.81 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2996  precorrin-6y c5,15-methyltransferase  29.66 
 
 
405 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
280 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.72 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  28.89 
 
 
348 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
267 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3145  hypothetical protein  27.78 
 
 
246 aa  47.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
234 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
348 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3503  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  27.87 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000429561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0035  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  26.27 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0481  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  27.12 
 
 
405 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.74 
 
 
271 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.74 
 
 
276 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  27.41 
 
 
350 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.4 
 
 
296 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
237 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>