76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37000 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
488 aa  978    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  38.26 
 
 
518 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  31.47 
 
 
510 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  30.49 
 
 
514 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  32.2 
 
 
499 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  31.79 
 
 
507 aa  156  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  30.48 
 
 
512 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
511 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  32.14 
 
 
590 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
511 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  25.43 
 
 
535 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  27.72 
 
 
535 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  29.89 
 
 
252 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  24.58 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  23.76 
 
 
514 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  27.06 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  24.38 
 
 
518 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  30.19 
 
 
509 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  26.19 
 
 
486 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  25.52 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  23.64 
 
 
521 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  28.34 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  24.05 
 
 
1144 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  26.05 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  24.83 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  26.39 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  24.32 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
1143 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  25.26 
 
 
1116 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.38 
 
 
402 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  36.84 
 
 
324 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  35.79 
 
 
315 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
367 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
366 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
360 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
204 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
204 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 
365 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
204 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
204 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.77 
 
 
346 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
344 aa  47.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
279 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  21.3 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
279 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  25.35 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.01 
 
 
541 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.73 
 
 
268 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
578 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  19.71 
 
 
399 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  27.52 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  29.81 
 
 
376 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
234 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  25.96 
 
 
253 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
261 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  26.67 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  35 
 
 
349 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  32.04 
 
 
541 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
541 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.91 
 
 
204 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>