More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0193 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  46.35 
 
 
197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  33.16 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  29.38 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.7 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 
276 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.74 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.25 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
280 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.44 
 
 
237 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.43 
 
 
233 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.63 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
274 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  32.59 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.87 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  31.19 
 
 
265 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
256 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  36.84 
 
 
274 aa  58.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.25 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.62 
 
 
330 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.73 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
255 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  27.22 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  34.62 
 
 
268 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  33.87 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  26.04 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.46 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.77 
 
 
276 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
280 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.19 
 
 
258 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2303  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 
390 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342078  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 
235 aa  55.1  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  25.99 
 
 
377 aa  55.1  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
392 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
319 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
293 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  37.12 
 
 
247 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  32.28 
 
 
251 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 
638 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
283 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
254 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
254 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.75 
 
 
263 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>