105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2205 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  60.21 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  49.48 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  46.52 
 
 
190 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  45.99 
 
 
190 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  45.08 
 
 
192 aa  170  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  39.34 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.7 
 
 
420 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.28 
 
 
205 aa  54.7  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  31.16 
 
 
313 aa  51.6  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  41.43 
 
 
265 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
330 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
334 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
330 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  27.95 
 
 
274 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 
272 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
224 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
265 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  27.86 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  25.44 
 
 
267 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
330 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2146  Methyltransferase type 11  23.42 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  27.54 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
333 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  25.68 
 
 
190 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
329 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
284 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 
256 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
186 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
231 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
257 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  33.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
330 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
278 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  34.38 
 
 
269 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.19 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
267 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  25 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  23.94 
 
 
631 aa  45.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
276 aa  44.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
327 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
274 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  29.17 
 
 
352 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  29.93 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2223  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
293 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128403  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  28.81 
 
 
328 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1057  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  34.34 
 
 
331 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.81 
 
 
275 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  24.85 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29 
 
 
266 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
295 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3416  methyltransferase  27.48 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  31.51 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
287 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
252 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 
272 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
358 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
284 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
261 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1490  hypothetical protein  22.22 
 
 
302 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  23.97 
 
 
280 aa  41.6  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.51 
 
 
216 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  31.11 
 
 
297 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
263 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
268 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
415 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
252 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1128  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.39 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
283 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
270 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  24.65 
 
 
243 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1696  hypothetical protein  31.78 
 
 
231 aa  41.2  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>