50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3127 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  100 
 
 		 191 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  60.21 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 190 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  47.87 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  48.4 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  39.67 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.77 
 
 		 420 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.86 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 252 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  29.61 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  30.95 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  26.85 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  23.64 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 267 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 273 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 274 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5873  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.307936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  23.81 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  28.79 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.05 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 245 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 276 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  23.31 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 240 aa  42  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 280 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 271 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 207 aa  42  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.08 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.81 
 
 		 345 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.62 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 285 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.46 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>