123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4456 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  100 
 
 
180 aa  361  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  46.15 
 
 
192 aa  170  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  45.05 
 
 
190 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  43.89 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  45.05 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
190 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  39.67 
 
 
191 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
188 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2146  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
231 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 
267 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
265 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 
329 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
255 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 
244 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
333 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1442  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0423534  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
217 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
624 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
341 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
287 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
194 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
239 aa  48.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
283 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
263 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.82 
 
 
285 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  23.23 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
341 aa  48.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
341 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.24 
 
 
420 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.81 
 
 
268 aa  47.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
208 aa  47.8  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
341 aa  47.8  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  33 
 
 
275 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
337 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
363 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
272 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  26.54 
 
 
251 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
281 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  24.77 
 
 
524 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
243 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.29 
 
 
228 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  24.6 
 
 
212 aa  44.7  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.56 
 
 
280 aa  44.7  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.91 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  25.32 
 
 
330 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.86 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0437  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3233  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
308 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
334 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.3 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 
457 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 
336 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5061  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
252 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  27 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
285 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
267 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
248 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
330 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
339 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
280 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  33.96 
 
 
368 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  42.86 
 
 
237 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
270 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  30 
 
 
708 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
328 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>