126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1842 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  100 
 
 
190 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  88.95 
 
 
190 aa  359  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  65.79 
 
 
192 aa  279  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  66.32 
 
 
192 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  50 
 
 
191 aa  184  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  46.52 
 
 
190 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  43.89 
 
 
180 aa  150  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  29.94 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.55 
 
 
205 aa  61.2  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  33.78 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
231 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
272 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.56 
 
 
420 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
255 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
210 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
216 aa  51.6  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.06 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2146  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  30.26 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  25.16 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
235 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
252 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.14 
 
 
305 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
274 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.07 
 
 
280 aa  48.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  28.7 
 
 
251 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
251 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
278 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  26.47 
 
 
335 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  33 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  33.98 
 
 
214 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
241 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.17 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
340 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.4 
 
 
242 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
415 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  32.69 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
239 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
283 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  29.66 
 
 
202 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
353 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  31.31 
 
 
353 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  26.85 
 
 
267 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  31.62 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
296 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
242 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
276 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.88 
 
 
272 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  35.04 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0118  methyltransferase type 12  26.76 
 
 
273 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
250 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
312 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.67 
 
 
296 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.17 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.17 
 
 
287 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
273 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
238 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.97 
 
 
256 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.97 
 
 
256 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.66 
 
 
256 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  29.82 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
246 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.55 
 
 
256 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 
275 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>