232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4072 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 192 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  72.4 
 
 		 192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  68.42 
 
 		 190 aa  291  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  65.79 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  47.87 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  45.08 
 
 		 190 aa  170  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  45.05 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  30.9 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.43 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2146  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.22 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  28.85 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  31.78 
 
 		 580 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  30.97 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  24.46 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40 
 
 		 403 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  28.57 
 
 		 267 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.27 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1442  methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0423534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.73 
 
 		 258 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  35.51 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.22 
 
 		 251 aa  48.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  30 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2368  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 345 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 256 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  30.71 
 
 		 273 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 442 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  28.46 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.49 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.19 
 
 		 457 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.84 
 
 		 865 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  30.09 
 
 		 306 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.12 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.04 
 
 		 280 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.7 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 267 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.12 
 
 		 256 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.29 
 
 		 353 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  27.73 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 353 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.97 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>