101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5873 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5873  Methyltransferase type 11  100 
 
 
174 aa  358  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.307936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1943  Methyltransferase type 11  43.35 
 
 
186 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.415083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0288  methyltransferase type 12  27.36 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.42 
 
 
233 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  31.48 
 
 
255 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.52 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
208 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
202 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  23.89 
 
 
248 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
209 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 
274 aa  47.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  26.89 
 
 
280 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
268 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  28.57 
 
 
344 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.96 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.69 
 
 
264 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  31.96 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  24.84 
 
 
216 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
262 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31 
 
 
259 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  28.4 
 
 
239 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
246 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
246 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
266 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
189 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
255 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
260 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
457 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
263 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
244 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.53 
 
 
257 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
222 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
191 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
243 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  30.99 
 
 
255 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
209 aa  44.3  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
506 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.89 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
243 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
264 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  28.06 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.94 
 
 
253 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  23.3 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
293 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  32 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
267 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
248 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.55 
 
 
235 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  26.32 
 
 
267 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  29.7 
 
 
263 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  23.53 
 
 
278 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
258 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
262 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 
264 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  32.32 
 
 
258 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
260 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
267 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
257 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
337 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0809  demethylmenaquinone methyltransferase  23.81 
 
 
233 aa  41.6  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0380502  hitchhiker  0.00800437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  24.52 
 
 
243 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3152  methyltransferase type 11  26.19 
 
 
252 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.953412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
357 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
251 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
269 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
328 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 
265 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
229 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  27.07 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
236 aa  41.2  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  31.13 
 
 
255 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  27.1 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.52 
 
 
257 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  26.98 
 
 
251 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.4 
 
 
207 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  29.13 
 
 
274 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
247 aa  41.2  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.43 
 
 
243 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  22.86 
 
 
199 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  34.65 
 
 
263 aa  40.8  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
273 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
267 aa  40.8  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  31.48 
 
 
269 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>