83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1943 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1943  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.415083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5873  Methyltransferase type 11  43.35 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.307936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  29 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.63 
 
 		 260 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.4 
 
 		 282 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1499  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 248 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.33 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1526  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 248 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.22 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  23.86 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.5 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 281 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 255 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 282 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 282 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  30.69 
 
 		 276 aa  44.7  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 282 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.77 
 
 		 244 aa  44.7  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  23.75 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 328 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.47 
 
 		 260 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.38 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.21 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.45 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 337 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 327 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  24.21 
 
 		 262 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  28.24 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 		 335 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.56 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 308 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.56 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0773  methyltransferase type 12  22.33 
 
 		 281 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  0.677345 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04841  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.53 
 
 		 232 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 230 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43688  predicted protein  32.41 
 
 		 378 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1762  demethylmenaquinone methyltransferase  28.18 
 
 		 232 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 246 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 234 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 240 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 		 257 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  26.25 
 
 		 307 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 282 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 242 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  32.58 
 
 		 344 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  32.58 
 
 		 280 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  29.52 
 
 		 252 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 		 252 aa  40.8  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.72 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 		 271 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 		 243 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 		 252 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 		 252 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>