79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0773 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0773  methyltransferase type 12  100 
 
 		 281 aa  583  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  0.677345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 399 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02216  methyltransferase  23.13 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  36.92 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  36.92 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  29.13 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 		 247 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.74 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.74 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.45 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.09 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.91 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.09 
 
 		 400 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  25.36 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  23.78 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.46 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  30.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  30.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  30.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0427  hypothetical protein  22.55 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  24.91 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.32 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.24 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.84 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2178  hypothetical protein  25.24 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  29.9 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2024  hypothetical protein  25.24 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1975  hypothetical protein  24.27 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  29.91 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  22.61 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2184  hypothetical protein  25.24 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.97 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 2112 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.15 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1993  hypothetical protein  24.27 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0193266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.42 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.96 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.59 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.26 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  30.36 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  23.89 
 
 		 207 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.44 
 
 		 202 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2239  hypothetical protein  24.27 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00467151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  22.92 
 
 		 1523 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  21.78 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  22.76 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  40.62 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.16 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.4 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.37 
 
 		 2012 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  25.74 
 
 		 241 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  30.91 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.39 
 
 		 230 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 251 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>