157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1472 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  100 
 
 
308 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  46.73 
 
 
308 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  52 
 
 
311 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  50.17 
 
 
308 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  46.13 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  51.16 
 
 
312 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  45.83 
 
 
329 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  50.66 
 
 
330 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  43.55 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  44.79 
 
 
315 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  42 
 
 
324 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  42.26 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  38.76 
 
 
326 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  41.7 
 
 
447 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  39.67 
 
 
310 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  38.36 
 
 
338 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  37.78 
 
 
311 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.96 
 
 
561 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.96 
 
 
561 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  36.89 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  36.69 
 
 
255 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  36.63 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  36.64 
 
 
436 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  33.1 
 
 
417 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
456 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  33.89 
 
 
436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  40 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  36 
 
 
456 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.46 
 
 
577 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.05 
 
 
577 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  34.31 
 
 
241 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  35.42 
 
 
272 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  35 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  35.02 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  32.67 
 
 
436 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  32 
 
 
439 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  23.48 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  35.32 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  27.37 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39 
 
 
244 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  23.1 
 
 
354 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.67 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
271 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  37 
 
 
246 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  26.09 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  18.8 
 
 
356 aa  50.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.66 
 
 
213 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
209 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  39 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.48 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.6 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
220 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  31.01 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  29.52 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
291 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
328 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
209 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
328 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
328 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.94 
 
 
258 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  37.37 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.46 
 
 
243 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  36.73 
 
 
203 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  37 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
226 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  33.33 
 
 
408 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.73 
 
 
269 aa  46.2  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
241 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
382 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
232 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  34 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  31.16 
 
 
250 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  27.95 
 
 
204 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  32.65 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.65 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  25.55 
 
 
195 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
206 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 
361 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  25.77 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>