91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0489 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  100 
 
 		 447 aa  882    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  37.45 
 
 		 308 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  41.7 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.96 
 
 		 561 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.96 
 
 		 561 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  39.15 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  36.98 
 
 		 311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  37.19 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  37.19 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  36.6 
 
 		 303 aa  128  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  37.61 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  37.84 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  33.21 
 
 		 324 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  32.4 
 
 		 276 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  32.4 
 
 		 255 aa  123  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  35.12 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  33.19 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27 
 
 		 577 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  33.58 
 
 		 308 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 417 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  33.2 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.33 
 
 		 577 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  35.68 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  30.26 
 
 		 326 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  32.38 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 272 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 272 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  35.51 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  26.69 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  20.56 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 244 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  31.51 
 
 		 204 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1069 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  29.94 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 291 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.89 
 
 		 230 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.34 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  20 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  31.17 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 250 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1297 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.44 
 
 		 258 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.44 
 
 		 258 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32655  predicted protein  31.01 
 
 		 269 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351809  normal  0.0198714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  24.21 
 
 		 219 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  31.43 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  31.69 
 
 		 203 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 220 aa  47  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.9 
 
 		 236 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.9 
 
 		 238 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.44 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 247 aa  46.6  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  25.4 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.38 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.36 
 
 		 252 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.36 
 
 		 252 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  29.53 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  21.89 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  29.9 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 218 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 231 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  28.24 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 215 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 270 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.87 
 
 		 238 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  37.33 
 
 		 199 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  25.26 
 
 		 210 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 735 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.47 
 
 		 235 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  34 
 
 		 242 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 275 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 252 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.13 
 
 		 291 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.66 
 
 		 258 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 232 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>