More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1594 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  100 
 
 
274 aa  550  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  72.96 
 
 
272 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  73.23 
 
 
272 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  67.5 
 
 
241 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  57.41 
 
 
276 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  55.22 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  55.69 
 
 
255 aa  275  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  37.98 
 
 
326 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  37.69 
 
 
324 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  37.45 
 
 
338 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  38.15 
 
 
303 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  36.88 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  39.74 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  37.79 
 
 
310 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  35.83 
 
 
456 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  35.68 
 
 
447 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  38.82 
 
 
330 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  35.57 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  36.58 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  34.66 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
444 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.66 
 
 
561 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.66 
 
 
561 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  35.63 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  35.39 
 
 
331 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  34.3 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  34.19 
 
 
439 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.47 
 
 
577 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.06 
 
 
577 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
315 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  35.65 
 
 
436 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  32.05 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  34.63 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  34.36 
 
 
436 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  31.27 
 
 
456 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  31.85 
 
 
417 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  34.31 
 
 
203 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  23.91 
 
 
356 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  28.79 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  28.03 
 
 
354 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 
221 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
175 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27 
 
 
230 aa  53.1  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.79 
 
 
421 aa  52.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
257 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  26.01 
 
 
394 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.69 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  30 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  24.21 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  25.43 
 
 
394 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 
420 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.47 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.89 
 
 
410 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.79 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  38.82 
 
 
210 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.98 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 
243 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 
234 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.02 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
211 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.79 
 
 
263 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
208 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.08 
 
 
447 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.15 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.67 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 
205 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  26.76 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.43 
 
 
672 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2396  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.25 
 
 
406 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
1314 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
442 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>