52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43435 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  100 
 
 
456 aa  945    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.63 
 
 
561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.63 
 
 
561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
331 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 
436 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.34 
 
 
577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.1 
 
 
577 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  34.34 
 
 
303 aa  110  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  32.38 
 
 
447 aa  109  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  32.07 
 
 
324 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  35.47 
 
 
330 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
315 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  30.59 
 
 
331 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  30.12 
 
 
276 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 
329 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  30.12 
 
 
255 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  31.89 
 
 
310 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 
312 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  29.23 
 
 
276 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  34.41 
 
 
308 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
311 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  33.46 
 
 
338 aa  96.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  30.61 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
444 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  30.97 
 
 
326 aa  93.2  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
311 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  31.28 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  29.25 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  31.45 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  31.27 
 
 
274 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  26.77 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  29.31 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  30.12 
 
 
272 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
272 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  22.84 
 
 
358 aa  58.2  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  24.06 
 
 
356 aa  57.8  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  26.58 
 
 
354 aa  55.1  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22190  hypothetical protein  30.07 
 
 
267 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.138955  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1546  generic methyltransferase  26.12 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
257 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
1340 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 
271 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  27.27 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  27.27 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.61 
 
 
293 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  26.26 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
220 aa  43.9  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  31.5 
 
 
795 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
210 aa  43.1  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>