More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3235 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  100 
 
 		 331 aa  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  95.77 
 
 		 331 aa  598  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  82.67 
 
 		 329 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  59.13 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  54.31 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  54.63 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  45.25 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  42.3 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  44.98 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  44.19 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  44.01 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  39.01 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  39.09 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  37.96 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  35.91 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  37.19 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  34.13 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  33.73 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  39.3 
 
 		 436 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  31.44 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.22 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  36.29 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  32.39 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  35.95 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  34.98 
 
 		 272 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  34.98 
 
 		 272 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.97 
 
 		 577 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  33.17 
 
 		 439 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  31.97 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 444 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.57 
 
 		 561 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.57 
 
 		 561 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  23.6 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 438 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  36.36 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  35.66 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.16 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  34.11 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  34.11 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  34.11 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  37.23 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  33.33 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  36.3 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  36.3 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  33.14 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  37.5 
 
 		 658 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  35.56 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.9 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.67 
 
 		 242 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.56 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  40 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  35.92 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  36 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.03 
 
 		 241 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 241 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.08 
 
 		 244 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  41.12 
 
 		 280 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.55 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.55 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  37.9 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  40.19 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  35.24 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  42.71 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.21 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  30.61 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  35.06 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.58 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>