More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1778 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  87.92 
 
 		 264 aa  461  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.79 
 
 		 254 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.79 
 
 		 254 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.79 
 
 		 254 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  52.73 
 
 		 250 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.64 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.44 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.71 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  48.13 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.67 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.35 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.76 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.82 
 
 		 252 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  51.33 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.72 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  46.54 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  46.46 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  45.91 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  44.44 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.14 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  41.18 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.06 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.62 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  41.51 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  47.66 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.43 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  40.07 
 
 		 307 aa  178  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.78 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.82 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.22 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.08 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.22 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.22 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.47 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.09 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  39.22 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.47 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.22 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.82 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.22 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.82 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.63 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.02 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.82 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.61 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.92 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.53 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.37 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.53 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.15 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.23 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.53 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.55 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.61 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.59 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.23 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.06 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.11 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.37 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.11 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.72 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.15 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.76 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.27 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.48 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.44 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.72 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.16 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.3 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.9 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.72 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  37.55 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  35.63 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  34.34 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.98 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.58 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  36.63 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.24 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.73 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  34.62 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  34.23 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.85 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.46 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.74 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.25 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.04 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0474  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.69 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.901578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  41 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3620  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.57 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29.55 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>