85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2622 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  100 
 
 
191 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
252 aa  91.3  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  28.09 
 
 
251 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
244 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  27.46 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  31.76 
 
 
252 aa  64.3  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  21.35 
 
 
255 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
244 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  24.74 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 
278 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
243 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.18 
 
 
420 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  24.58 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  20.45 
 
 
202 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.69 
 
 
265 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  24.64 
 
 
267 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  25 
 
 
191 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.89 
 
 
264 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  22.94 
 
 
263 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
263 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
232 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0437  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.72 
 
 
256 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.58 
 
 
260 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  24.39 
 
 
258 aa  44.7  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
264 aa  44.7  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.19 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  29.1 
 
 
279 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
267 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  24.3 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4541  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.37 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.05 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  32 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0191  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltrans ferase  29.33 
 
 
404 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  20.29 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  27.68 
 
 
355 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  23.81 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5873  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.307936  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.22 
 
 
207 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 
283 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21190  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit,precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  33.73 
 
 
451 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2801  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.81 
 
 
398 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78104  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12070  protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase  31.67 
 
 
382 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  37.31 
 
 
288 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  29.06 
 
 
342 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  27.73 
 
 
338 aa  41.2  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
263 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1718  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
222 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000284846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
236 aa  41.2  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
255 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  23.48 
 
 
254 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
220 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
269 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  28 
 
 
291 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  28.09 
 
 
309 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>