117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1696 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1696  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  484  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  28.81 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06749  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
291 aa  52  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0228436  normal  0.0192751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  24.65 
 
 
249 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
255 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.58 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
339 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
327 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.17 
 
 
305 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 
341 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  29.41 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05874  hypothetical protein  46.3 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.813771 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02165  TAM domain methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15860)  29.9 
 
 
373 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475648  normal  0.123223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.47 
 
 
262 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1712  hypothetical protein  25.17 
 
 
681 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.050102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1909  hypothetical protein  25.17 
 
 
676 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  27.89 
 
 
328 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1736  hypothetical protein  25.17 
 
 
681 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1686  hypothetical protein  25.17 
 
 
676 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1874  hypothetical protein  25.17 
 
 
681 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
335 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
411 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 
273 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  26.53 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  29.6 
 
 
220 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  28.18 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
288 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
235 aa  47  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 
317 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.19 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
283 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
337 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  24.79 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  27.91 
 
 
287 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  23.66 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07933  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 
335 aa  45.1  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  28.21 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  26.05 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  27.5 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.13 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.75 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.42 
 
 
303 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  25.83 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  26.71 
 
 
354 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  26.88 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  28 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  25.66 
 
 
183 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
294 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  20.9 
 
 
365 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
424 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1731  hypothetical protein  23.18 
 
 
676 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  26.85 
 
 
342 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 
300 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08945  methyltransferase LaeA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01930)  29.03 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.96 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.83 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  30.71 
 
 
355 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  25.58 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  23.31 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  22.64 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
300 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  28.95 
 
 
343 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
341 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  28.57 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
341 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.53 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  22.69 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.2 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.61 
 
 
260 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>