102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3967 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  100 
 
 
359 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  88.58 
 
 
359 aa  630  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  59.89 
 
 
360 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  53.93 
 
 
370 aa  348  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  53.06 
 
 
360 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  53.17 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  32.66 
 
 
399 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.6 
 
 
395 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  35.08 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  29.08 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  30.47 
 
 
400 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.47 
 
 
400 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  31.94 
 
 
414 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 
399 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  31.21 
 
 
780 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  31.94 
 
 
631 aa  89.7  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  30.8 
 
 
407 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  31.18 
 
 
779 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
779 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  28.52 
 
 
400 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  25.1 
 
 
580 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  29.76 
 
 
704 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  25.21 
 
 
653 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  28.69 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  29.63 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  27.71 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.31 
 
 
865 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.41 
 
 
1676 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.36 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  26.18 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
661 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.95 
 
 
875 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
267 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.01 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
268 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
444 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 
542 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  28 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  28 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
270 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 
238 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 
441 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  24.83 
 
 
518 aa  50.4  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 
441 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.59 
 
 
242 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0839  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.31 
 
 
238 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
285 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  26.7 
 
 
523 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.95 
 
 
238 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.82 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 
494 aa  49.3  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.63 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.59 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
251 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.84 
 
 
293 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.63 
 
 
246 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
242 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.9 
 
 
260 aa  46.2  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.5 
 
 
235 aa  46.2  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 
273 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
240 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  31 
 
 
272 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.26 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.02 
 
 
246 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
276 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
247 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2580  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.28 
 
 
249 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.09 
 
 
238 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.83 
 
 
234 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  25.85 
 
 
535 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.94 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 
241 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
276 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
354 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  38.46 
 
 
273 aa  43.5  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
244 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0437  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3003  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  24.58 
 
 
514 aa  43.1  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
243 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  hitchhiker  0.00870455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
535 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 
232 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
239 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>